Jonavos 4-oji vidurinė mokykla pradeda veikti 1974 m. rugsėjo 15 dieną.
Per 20 metų išleidžia 1325 abiturientus (iš jų — 12 aukso, 47 sidabro medalininkai).
Nuo 1994 m . pradedama mokytis realinio ir humanitarinio profilio gimnazijos klasėse.
1995 metais rugsėjo 1-ąją dieną suteikiamas Senamiesčio vidurinės mokyklos vardas.
1998 m. Senamiesčio vidurinę baigia pirmieji gimnazistai (5 iš jų su pagyrimu), mokyklai suteikiamas gimnazijos statusas, ji reorganizuojama į keturmetę Jonavos Senamiesčio gimnaziją ir pagrindinę mokyklą.
1974—1998 m. mokyklai vadovavo A. Katinas, 1998—1999 m. — I. Šidlauskaitė (Banevičienė).
Nuo pat mokyklos įkūrimo itin stiprios chemijos ir matematikos dėstymo tradicijos (mokytojai ekspertai J. Katinienė, A. Dekontas).
1999 m. išleidžiama pirmoji gimnazistų laida (50 abiturientų; 3 iš jų gimnaziją baigia su pagyrimu).
2000 m. iškeliama pagrindinė mokykla, gimnazistai tampa viso pastato šeimininkais.